Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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GcaQ8VC88 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GcaQ8VC88 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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