Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms