Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfcQ8CI19 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfcQ8CI19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms