Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim32Q8CH72 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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