Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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