Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp27Q8CEG8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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