Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rdh13Q8CEE7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rdh13Q8CEE7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rdh13Q8CEE7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh13Q8CEE7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms