Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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