Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms