Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms