Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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