Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms