Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp398Q8BV16 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms