Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubash3bQ8BGG7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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