Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbed4Q80WQ9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms