Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pcsk9Q80W65 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms