Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Tnfsf18Q7TS55 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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