Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ScocQ78YZ6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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