Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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