Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms