Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms