Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms