Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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