Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt9Q6RHW0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms