Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms