Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttbk1Q6PCN3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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