Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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