Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt77Q6IFZ6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt77Q6IFZ6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms