Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rftn1Q6A0D4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms