Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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