Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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