Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a5Q63ZW6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms