Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt33bQ61897 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt33bQ61897 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms