Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha7Q61772 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha7Q61772 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms