Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms