Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Znrf3Q5SSZ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Znrf3Q5SSZ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms