Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms