Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlha9Q5RJB0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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