Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trp53i11Q4QQM4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trp53i11Q4QQM4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms