Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lin28bQ45KJ6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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