Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms