Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm28047Q3US59 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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