Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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