Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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