Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nom1Q3UFM5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms