Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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