Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fam117bQ3U3E2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms