Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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