Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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