Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms